微生物肥料是指用特定微生物菌种培养生产的具有活性微生物的制剂。它无毒无害、不污染环境，通过特定微生物的生命活力能增加植物的营养或产生植物生长激素，促进植物生长。

凡是植物正常生长发育必不可少的元素，叫做必需营养元素。现在在植物体中已发现了70种以上的元素，但并不都是植物必需营养元素。根据研究，必需营养元素有16种，它们是：碳(C)、氢(H)、氧(O)、氮(N)、钾(K)、磷（P）、钙(Ca)、镁(Mg)、硫(S)、铁(Fe)、锰(Mn)、锌(Zn)、硼(B)、钼(Mo)、铜(Cu)、氯(Cl)。

生物肥以有机溶液或草木灰等有机物为载体接种有益微生物而形成的一类肥料。主要功能成分为微生物菌。它本身不能直接作为肥料提供养分。

按作用机理分两大类：一类是微生物菌施入土壤后，在土壤环境中大量繁殖，成为作物根区优势菌株，增加土壤矿物养分的分解、释放，提高土壤养分供应能力。另一类是微生物施入土壤后，通过微生物区系的变化或分泌物的影响，改变作物根区环境，促进作物根系发育，提高作物吸收利用养分能力。